Суперпродукция архитектурного фактора бактериального нуклеоида H-NS и оценка его функциональной активности
Ключевые слова:
специфическая сорбция антител, электрофорез, молекулярное клонирование, нуклеоид, H-NS, E. coli, аффинная хроматография.
Аннотация
С помощью методов молекулярного клонирования был получен вектор для эффективной
суперпродукции рекомбинантного белка H-NS – одного их основных структурных белков
бактериального нуклеоида, который также принимает участие в регуляции транскрипции.
Разработанный метод позволяет оценивать эффективность связывания белка H-NS c ДНК-мишенями
в нативных условиях и детектировать комплексы с помощью специфической сорбции антител на 6
остатков гистидина, введённых в С-конец белка. Кроме того, он делает возможной одностадийную
очистку функционально активного белка H-NS с помощью аффинной хроматографии.
Скачивания
Данные скачивания пока не доступны.
Литература
1.Blattner F.R. et al., Science, 1997, Vol. 277,
pp. 1453-1462.
2.Ozoline O.N., Shavkunov K.S., Tutukina
M.N., Bulletin of Biotechnology, 2005, No 1,
pp. 56-65.
3.Lee H.J., Hong S.H., FEMS Microbiol Lett,
2012, Vol. 326(2), pp. 131-136. doi:
10.1111/j.1574-6968.2011.02441.x.
4.Shavkunov K.S., Masulis I.S., Tutukina
M.N. et al., Nucleic Acids Res, 2009, Vol. 37,
pp. 4919-4931. doi: 10.1093/nar/gkp490.
5.Glazunova O.A., Kiselev S.S., Shavkunov
K.S. et al., Math. Biol. Bioinf., 2014, Vol. 9 (2),
pp. 563-574. doi: 10.17537/2014.9.563.
6.Reppas N., Wade J., Church G., Struhl K.,
Mol. Cell, 2006, Vol. 24, pp. 747-757.
7.Taft RJ, Hawkins PG, Mattick JS et al.,
Epigenetics and chromatin, 2011, Vol. 4.
pp. 13.
8.Panyukov V.V., Ozoline O.N., PLoS One,
2013, Vol. 8(5):e62601. doi:
10.1371/journal.pone.0062601
9.Dorman C.J., Nat Rev Microbiol, 2004, Vol.
2(5), pp. 391-400.
10. Falconi M., Higgins P.N. et al., Mol.
Microbiol, 1992, Vol. 10, pp. 273-282.
11. Westra E.R. et al, Mol. Microbiol, 2009,
Vol. 77, pp. 1380-1393. doi:
10.1016/j.molcel.2012.03.018.
12. Dole S., Nagarajavel V., Schnetz K.,
Mol. Microbiol, 2004, Vol. 52 (2), pp. 589-600.
13. Dersch P., Schmidt K., Bremer E., Mol.
Microbiol, 1993, Vol. 8(5), pp. 875-889.
14. Schnetz K., Wang J.C., Nucleic Acids
Res, 1996, Vol. 24 (12), pp. 2422-2428.
15. Davis B.J., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1994,
Vol. 121, pp. 404-427.
16. Igarashi K., Ishihama A., Cell, 1991,
Vol. 65, pp. 1015-1022.
17. Shindo H., Ohnuki A., Ginba H. et al.,
FEBS Lett., 1999, Vol. 455, pp. 63-69.
18. Potapova A.V., Ozoline O.N., Tutukina
M.N. Sorbtsionnye i khromatograficheskie
protsessy, 2014, Vol.14(3), pp. 537-543.
19. Panyukov V.V., Kiselev S.S., Shavkunov
K.S. et al., Math. Biol. Bioinf., 2013, Vol.
8:t12-t26. doi: 10.17537/2013.8.t12
20. Lang B., et al., Nucleic Acids Res, 2007,
Vol. 35, pp. 6330-6337.
21. Landick R., Wade J.T., Grainger D.C.,
Curr. Op. Microbiol, 2015, Vol. 24, pp. 53-59.
22. Arold S.T., Leonard P.G., Parkinson
G.N., Ladbury J.E., Proc Natl Acad Sci USA,
2010, Vol. 107, pp. 15728-15732. doi:
10.1073/pnas.1006966107
23. Hansen A-M., Chaerkady R., Sharma J.,
et al., PLoS Pathog, 2013, Vol. 9(6), e1003403.
doi:10.1371/journal.ppat.1003403
pp. 1453-1462.
2.Ozoline O.N., Shavkunov K.S., Tutukina
M.N., Bulletin of Biotechnology, 2005, No 1,
pp. 56-65.
3.Lee H.J., Hong S.H., FEMS Microbiol Lett,
2012, Vol. 326(2), pp. 131-136. doi:
10.1111/j.1574-6968.2011.02441.x.
4.Shavkunov K.S., Masulis I.S., Tutukina
M.N. et al., Nucleic Acids Res, 2009, Vol. 37,
pp. 4919-4931. doi: 10.1093/nar/gkp490.
5.Glazunova O.A., Kiselev S.S., Shavkunov
K.S. et al., Math. Biol. Bioinf., 2014, Vol. 9 (2),
pp. 563-574. doi: 10.17537/2014.9.563.
6.Reppas N., Wade J., Church G., Struhl K.,
Mol. Cell, 2006, Vol. 24, pp. 747-757.
7.Taft RJ, Hawkins PG, Mattick JS et al.,
Epigenetics and chromatin, 2011, Vol. 4.
pp. 13.
8.Panyukov V.V., Ozoline O.N., PLoS One,
2013, Vol. 8(5):e62601. doi:
10.1371/journal.pone.0062601
9.Dorman C.J., Nat Rev Microbiol, 2004, Vol.
2(5), pp. 391-400.
10. Falconi M., Higgins P.N. et al., Mol.
Microbiol, 1992, Vol. 10, pp. 273-282.
11. Westra E.R. et al, Mol. Microbiol, 2009,
Vol. 77, pp. 1380-1393. doi:
10.1016/j.molcel.2012.03.018.
12. Dole S., Nagarajavel V., Schnetz K.,
Mol. Microbiol, 2004, Vol. 52 (2), pp. 589-600.
13. Dersch P., Schmidt K., Bremer E., Mol.
Microbiol, 1993, Vol. 8(5), pp. 875-889.
14. Schnetz K., Wang J.C., Nucleic Acids
Res, 1996, Vol. 24 (12), pp. 2422-2428.
15. Davis B.J., Ann. N.Y. Acad. Sci., 1994,
Vol. 121, pp. 404-427.
16. Igarashi K., Ishihama A., Cell, 1991,
Vol. 65, pp. 1015-1022.
17. Shindo H., Ohnuki A., Ginba H. et al.,
FEBS Lett., 1999, Vol. 455, pp. 63-69.
18. Potapova A.V., Ozoline O.N., Tutukina
M.N. Sorbtsionnye i khromatograficheskie
protsessy, 2014, Vol.14(3), pp. 537-543.
19. Panyukov V.V., Kiselev S.S., Shavkunov
K.S. et al., Math. Biol. Bioinf., 2013, Vol.
8:t12-t26. doi: 10.17537/2013.8.t12
20. Lang B., et al., Nucleic Acids Res, 2007,
Vol. 35, pp. 6330-6337.
21. Landick R., Wade J.T., Grainger D.C.,
Curr. Op. Microbiol, 2015, Vol. 24, pp. 53-59.
22. Arold S.T., Leonard P.G., Parkinson
G.N., Ladbury J.E., Proc Natl Acad Sci USA,
2010, Vol. 107, pp. 15728-15732. doi:
10.1073/pnas.1006966107
23. Hansen A-M., Chaerkady R., Sharma J.,
et al., PLoS Pathog, 2013, Vol. 9(6), e1003403.
doi:10.1371/journal.ppat.1003403
Опубликован
2018-02-19
Как цитировать
Швырёва, У. С., Тутукина, М. Н., & Озолинь, О. Н. (2018). Суперпродукция архитектурного фактора бактериального нуклеоида H-NS и оценка его функциональной активности. Сорбционные и хроматографические процессы, 15(3), 435-442. https://doi.org/10.17308/sorpchrom.2015.15/291
Раздел
Статьи
