«Промоторные островки» генома E. coli как мишени для сорбции ферментов процессинга РНК
DOI:
https://doi.org/10.17308/sorpchrom.2015.15/310Ключевые слова:
E. coli, промоторные островки, pull-down assays.Аннотация
Фрагменты ДНК, взятые из обогащенных промоторами участков генома E. coli («промоторных островков»), были иммобилизованы на покрытых стрептавидином магнитных шариках и использованы для сорбции белков клеточного лизата (pull-down assays). В результате масс- спектрометрического анализа фракции белков, способных взаимодействовать с такими фрагментами ДНК, было идентифицировано, по крайней мере, два белка процессинга РНК (экзорибонуклеаза Rnr и РНК-хеликаза SrmB), а также РНК-хеликаза деградосомы (RhlB). Это свидетельствует о том, что «Промоторные островки» могут служить источником функционально значимых РНК, подвергающихся контролируемому пост-транскрипционному процессингу.









