Сравнительная характеристика сорбционных способов выделения бактериальной и грибковой ДНК из пыльцы

Mikhail Yu. Syromyatnikov; Alexey V. Lopatin; Anastasia V. Kokina; Alexey V. Salnikov; Vasiliy N. Popov

Mikhail Yu. Syromyatnikov Сыромятников Михаил Юрьевич -к.б.н., преподаватель кафедры генетики, цитологии и биоинженерии, ВГУ, Воронеж, тел. +7 (473) 220-88-72
Alexey V. Lopatin Лопатин Алексей Васильевич -к.б.н., вед.биолог биологического учебно-научного центра «Веневитиново», Воронеж
Anastasia V. Kokina Кокина Анастасия Васильевна магистрант кафедры генетики, цитологии и биоинженерии, ВГУ, Воронеж
Alexey V. Salnikov Сальников Алексей Владимирович -к.б.н., инженер кафедры биохимии и физиологии клетки, ВГУ, Воронеж
Vasiliy N. Popov Попов Василий Николаевич -д.б.н., заведующий кафедрой генетики, цитологии и биоинженерии, ВГУ, Воронеж

Ключевые слова: пыльца, выделение ДНК, сорбция, эффективность метода, бактерии, грибы.

Аннотация

В настоящее время широкое распространение получили методы выделения ДНК и РНК, основанные на связывании нуклеиновых кислот с сорбирующими носителями. Их эффективность при выделении бактериальной, грибковой и растительной ДНК из пыльцы не оценена. Нами проведена сравнительная характеристики коммерческих наборов –«Проба-ГС», «Нуклеосорб, Комплектация "С"» и «Quick-gDNA™ MiniPrep», а также классического метода экстракции ДНК с помощью органических растворов – при выделении ДНК бактерий и грибов из пыльцы, собранной пчелами. Показано, что методы на основе сорбции нуклеиновых кислот полностью избавляют ДНК от примесей РНК. При этом наибольшие концентрации ДНК получены при использовании набора «Нуклеосорб. Комплектация С». При анализе относительной экспрессии генов бактерий, растений и грибов не было выявлено существенных отличий в эффективности выделения различными наборами.

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Литература

1.
Barnett R., Larson G.A., Methods Mol. 6. Selemenev V.F., Rudakov O.B., Biol., 2012, Vol. 840, pp 13-19. Slavinskaja G.V., Drozdeva N.V., M., DeLi
2.
Cady N.C., Stelick S., Batt C.A., Biosens print, 2008, 246 p. Bioelectron., 2003, Vol. 19, pp. 59-66. 7. Karpov S.I., Matveeva M.V., Selemenev
3.
Melzaka K.A., Sherwooda C.S., Turnerb V.F., Russian Journal of Physical Chemistry A. R.F.B., Haynesc C.A., J. of Colloid and 2001, Vol. 75, No 2, pp. 266-271. Interface Science, 1996, Vol. 181, No 2, 8. González G., Hinojo M.J., Mateo R., pp 635-644. Medina A. et al., Int. J. Food Microbiol, 2005,
4. Poeckh T., Lopez S., Fuller A.O., Solomon Vol. 105, pp. 1-9.
M.J. et al. // Anal Biochem. 2008. Vol. 373, pp. 9. Kacániová M., Fikselová M., Ann. Agric 253-262. Environ Med., 2007, Vol. 14, pp. 229-232.
5. Kendall D., Lye G.J., Levy M.S., Biotechnol Bioeng., 2002, Vol. 79, pp. 816-822
10. Hebert P.D., Ratnasingham S., deWaard J.R., Proc. Biol. Sci.., 2003, Vol. 270, pp. 9699.
11. Schoch C.L., Seifert K.A., Huhndorf S., Robert V. et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 2012, Vol. 109, pp. 6241-6246.
12.
Dong W., Cheng T., Li C., Xu C. et al., Mol. Ecol. Resour., 2014, Vol. 14, No 2, pp. 336-343.
13.
Sameer A., Barghouthi A., Indian J. Microbiol., 2011, Vol. 51, pp. 430-444.