Способность пресноводных нитчатых серобактерий семейства Beggiatoaceae к ассимиляции молекулярного азота: молекулярная детекция и экспрессия маркерного гена азотфиксации nifH
Аннотация
При помощи сорбирующих микроколонок выделена РНК из трех штаммов серобактерий из семейства Beggiatoaceae. Показано значительное увеличение экспрессии маркерного гена азотфиксации nifH при культивировании на среде без источников азота по сравнению с полной средой. В геномах Beggiatoa leptomitiformis D-402 и «Thioflexothrix psekupsi»” D3 gen. nov., sp. nov. выявлены гены, необходимые для функционирования нитрогеназного комплекса. Все это подтверждает способность исследуемых штаммов к фиксации молекулярного азота.
Скачивания
Литература
2.
Brooks J.M., Kennicutt M.C., Fisher C.R. et al. Science, 1987, Vol. 238, pp.1138-1142.
3.
Sarbu S., Kane T., Kinkle B., Science, 1996, Vol. 272, pp. 1953-1955.
4.
Zehr J.P., Waterbury J.B., Turner P.J. et al., Nature, 2001 Vol. 412, pp. 635-638.
5.
Desai M.S., Brune A,. ISME J., 2012, Vol. 6, pp. 1302-1313.
6.
Nelson D.C., Waterbury J.B., Jannasch H.W., Arch. Microbiol., 1982, Vol. 133, pp. 172-177.
7.
Kojima H., Ogura Y., Yamamoto N. et al., ISME J., 2015, Vol. 9, pp. 1166-1176.
8.
Martinez-Romero E., Dinitrogen-Fixing Prokaryotes, The Prokaryotes, 3nd edn et al., 2006, Vol. 2, pp. 793-817.
9.
Fedorov D.N., Ivanova E.G., Doronina N.V., Trocenko Ju.A., Mikrobiologija, 2008, Vol. 77, pp. 286-288.
10.Zehr J.P., Jenkins B.D., Short S.M., Steward G.F., Environ Microbiol., 2003, Vol. 5, pp. 539-54.
11.Grabovich M.Y., Patritskaya V.Y., Muntyan M.S., Dubinina G.A., FEMS Microbiol Lett., 2001, Vol. 204, pp. 341-345.
12.Orlova M.V., Fedonenko Ju.P., Evstigneeva S.S. et al., Sorbtsionnye i khromatograficheskie protsessy, 2015, Vol. 15, No 4, pp. 578-585. 13.Pfenning N.D., Lippert K.D., Arch. Microbiol., 1966, Vol. 55, pp. 245-256.
14.Selemenev V.F., Slavinskaja G.V., Hohlov V.Ju., Chikin G.A., Praktikum po ionnomu obmenu, Voronezh, 1999, 160 p.
15.Selemenev V.F., Rudakov O.E., Slavinskaja G.V., Drozdova N.V., Pigmenty pishhevyh proizvodstv (melanoidiny), M., DeLi print, 2008, 246 p.
16.Fomenkov A., Vincze T., Grabovich M.Y. et al., Genome Announcement, 2015, Vol. 3. e01436-15. doi:10.1128/genomeA.01436-15.