Полинуклеотид фосфорилаза Pnp и экзонуклеаза Rnr Escherichia coli, выделенные специфической сорбцией на нуклеиновые кислоты, процессируют РНК-продукты «промоторных островков»

Maria N. Tutukina; Yury A. Purtov; Uliana S.- Shvyreva; Alexander A. Bykov; Konstantin S. Shavkunov; Olga A. Glazunova; Olga N. Ozoline

Авторы

Maria N. Tutukina Тутукина Мария Николаевна – к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории функциональной гено- мики и клеточного стресса Института биофизики клет- ки РАН, Московская область г.ущино
Yury A. Purtov Пуртов Юрий Александрович – к. . ., старший научный сотрудник лаборатории функциональной гено- мики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область Пущино
Uliana S.- Shvyreva Швырева Ульяна Сергеевна – к.б.н., научный сотрудник лаборатории функциональной геномики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область, Пущино
Alexander A. Bykov Быков Александр Андреевич – старший лаборант лаборатории функциональной геномики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область, Пущино, тел.: (4967) 739-140
Konstantin S. Shavkunov Шавкунов Констанин Сергеевич – к. б. н., старший научный сотрудник лаборатории функциональной ге- номики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область Пущино, тел: (4967) 739-140
Olga A. Glazunova Глазунова Ольга Андреевна – аспирант лаборатории функциональной геномики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область, Пущино, тел.: (4967) 739-140
Olga N. Ozoline Озолинь Ольга Николаевна – д.б.н., профессор, заведующая лабораторией функциональной геномики и клеточного стресса Института биофизики клетки РАН, Московская область, Пущино

Ключевые слова:

E. coli, «промоторные островки», олигонуклеотиды, короткие РНК бакте- рий, сорбция на магнитные шарики, LC/MS спектроскопия.

Аннотация

Иммобилизованные на магнитных шариках короткие РНК E. coli были использованы для
специфической сорбции белков клеточного лизата. Методом LC/MS спектрометрии был выявлен на-
бор связывающихся белков, включающий экзонуклеазу Pnp. Исследована способность Pnp и РНКазы
специфического процессинга Rnr влиять на количество коротких и длинных РНК, синтезируемых с
обогащённых промоторами участков генома. Делеция гена rnr увеличивала количество всех исследо-
ванных РНК в бактериальных клетках, а делеция pnp влияла на продукты 3 из 4 геномных областей.
Посттранскрипционный процессинг, следовательно, важен для генезиса исследованных РНК, что де-
лает возможным их участие в каких-то клеточных процессах.